转座子突变体库构建与 cubes-seq 插入位点鉴定
项目背景
客户需构建大规模随机突变体文库,用于解析基因功能、筛选关键表型。传统全基因组重测序定位插入位点成本高、周期长,难以支撑高通量筛选。
技术路线
- 突变体库构建:根据菌株特性选择 mariner/Tn5 等转座子系统,构建覆盖度足够的随机插入突变体库。
- 单克隆挑取与保存:自动化挑取单克隆并建立 96 孔板保存体系。
- 插入位点鉴定:以自主研发的 cubes-seq 技术替代常规重测序,快速、低成本确定转座子插入位点。
- Tn-Seq 分析:结合表型筛选与插入位点统计,定位候选关键基因。
交付成果
- 覆盖度达标的高质量转座子突变体库
- 单克隆库与插入位点鉴定报告
- cubes-seq 数据与 Tn-Seq 分析结果
- 突变体鉴定成本与周期显著下降,高效锁定目标基因
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