细胞膜蛋白 Pulldown 与宿主互作分析

致病性细菌或真菌通过哪些效应蛋白靶向宿主细胞的应答因子,是微生物领域的研究热点。锐志魔方现已建立高效、成熟的细胞膜蛋白 pulldown 技术服务体系,可在机制层面为用户提供病原菌与宿主相互作用机制的深度解析。

技术流程

  1. 裂解并获得目标宿主细胞膜蛋白。
  2. 利用 EZ-Link Sulfo-NHS-LC-生物素对细胞膜蛋白进行生物素化修饰。
  3. 将标记后的宿主细胞膜蛋白与病原菌菌体蛋白孵育并进行 pulldown。
  4. 结合质谱技术鉴定捕获的潜在效应蛋白。
  5. 通过 GST pulldown、siRNA 沉默、敲除株构建及 Western blot 等手段进行验证。
细胞膜蛋白 pulldown 技术流程
细胞膜蛋白 pulldown 技术流程:从宿主细胞膜蛋白制备、生物素化标记到潜在菌体效应蛋白的捕获与质谱鉴定。

典型案例思路

以咽峡炎链球菌(Streptococcus anginosus)研究为例,通过细胞膜蛋白 pulldown 技术从菌体蛋白中筛选到表面膜蛋白 TMPC;进一步利用 GST-TMPC 与胃上皮细胞蛋白 pulldown-MS 鉴定出潜在受体因子 ANXA2;并通过敲除株构建与动物模型验证,证明 TMPC-ANXA2 互作通过 MAPK 信号通路促进胃黏膜病变。

TMPC 敲除株对宿主细胞黏附侵袭及肿瘤形成的影响
TMPC 敲除株与野生株相比,对胃上皮细胞的黏附、侵袭及肿瘤促进能力均显著下降,验证 TMPC 为关键效应蛋白。

服务价值

  • 高通量筛选病原微生物效应蛋白与宿主应答因子。
  • 为病原菌致病机制、药物靶点筛选及防治策略研究提供线索。
  • 可与基因编辑、转座子文库、动物模型等服务组合形成完整证据链。